در مواردی که کیست ساده باشد، باید درمان را از روش‌های ساده آغاز کرد. این قاعده همیشه در طب سنتی رعایت می‌شود. اما اگر درمان‌های ساده نتیجه نداد، تحت نظر متخصص طب سنتی درمان‌ها ترکیبی و قوی‌تر می‌شوند.

کیست‌های ساده کلیه معمولاً با تقویت کلیه و بدن به‌مرور درمان می‌شوند. مثلاً روغن‌مالی با روغن‌های گرم روی کلیه‌ها بسیار مفید است. همچنین گرم نگه‌داشتن کلیه‌ها با استفاده از کلیه‌بند یا شکم‌بندهای پشمی توصیه می‌شود.

برای تقویت کلیه، ترکیب مقوی شامل زنیان و آویشن آسیاب‌شده به مقدار مساوی، به‌همراه کمی نمک و یک قاشق مرباخوری از این ترکیب را هر شب با یک عدد گردو میل کنند.

افراد باید از غذاهایی که مواد زائد تولید می‌کنند یا موجب یبوست می‌شوند مانند غذاهای سنگین و فست‌فودها پرهیز کنند.

اگر افراد در سنین بالاتر مجدداً دچار کیست شدند، باید به مسئله دفع ناقص و یبوست توجه ویژه داشته باشند. در این موارد، تقویت گوارش با مصرف سویق‌ها توصیه می‌شود تا مسیر دفع بدن فعال شود.